丁华侨¹ , 毛俐慧 ¹ , 胡伟¹ , 董青¹ , 刘建新^1,2*

1浙江省萧山棉麻研究所,杭州, 311202; 2绍兴文理学院元培学院,绍兴, 312000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2020年02月29日    接受日期: 2020年03月05日    发表日期: 2021年06月02日

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为了获得姜荷花叶绿素降解的关键酶基因PPH 信息，本试验在前期通过姜荷花全长转录组测序获得大量转录组信息的基础上，进行筛选分析，获得了 2条PPH 基因，分别命名为PPH1 和PPH2。PPH1 基因(GenBank: MT077178)，cDNA序列全长 1 795 bp，开放阅读框 1 437 bp (138~1 574 bp)，编码一条 478 aa的氨基酸序列。PPH2 基因(GenBank: MT077179)，cDNA序列全长 1 393 bp，开放阅读框 1 227 bp (70~1 296 bp)，编码一条 408 aa的氨基酸序列。采用 BLAST、Translate tool (ExPASy)、Clustal Omega、Find Conserved Domains(NCBI)、ProtParam、TMHMM Server、SOPMA、SWISS-MODEL、ClustalX (1.81)、MEGA 4.1等预测和分析了这2个基因编码蛋白氨基酸的一级结构(包括氨基酸序列的组成,保守区,理化特征等)、二级结构、三级结构及分子系统进化关系。PPH1 和PPH2 的核苷酸与蛋白氨基酸序列与其它物种的PPH 基因都具有很高的同源性，两者都包含有水解酶(Hydrolase)特征 PLN02578的保守区。分子系统进化分析表明，姜荷花的PPH1和PPH2 聚为一小类，然后与小果野芭蕉PPH (XP_018677219.1)的亲缘关系最为接近，而与双子叶植物的关系较远。本研究为后期通过遗传转化手段改良姜荷花不育苞片的颜色提供了分子基础
 

姜荷花；叶绿素；PPH (Pheophytinase gene)；基因